中国科学院海藻种质库是中国科学院生物遗传资源库下属的8个库之一，1996年成立。具有以下职责和功能：负责收集、鉴定和活体保存我国沿海的大型和微型海藻物种；为我国高校、科研院所、水产养殖企业等提供大型和微型海藻活体种质材料和技术咨询服务；发展和优化新海藻种质保存和基因条码鉴定技术; 深度挖掘具有重要经济、生态意义的大型和微型海藻种质资源，发展新种质创制技术，为我国庞大的海藻产业提供种质材料和技术服务。
海藻种质库目前工作人员10人，包括责任研究员、固定工作人员、博士后工作人员、硕士和博士研究生以及临时聘用人员等。